静脉药物配置中心因地处负一楼，净化空调系统设计尤为重要，因此运用了独立强效的空调系统，而不是依赖于原大楼的空调系统，增加了新风比例，从而保证新鲜空气的供给。本中心洁净区域的空气通过高效过滤器垂直层流进入室内，高效过滤器可过滤空气中的微粒及细菌，该区域的级别为10 000级。抗生素肿瘤药配置间配备生物安全柜，主要用于配置有致敏作用的抗生素和细胞毒性药物，房间相对于缓冲走廊为负压，相对于准备间为正压。生物安全柜排出的气体均由排风口吸走，通过管道排出室外，不再参与循环再利用。普通营养药配置间配备垂直层流操作台，可形成局部100级的洁净区域，主要用于配置TPN和对人体无害的抗生素及普通的电解质溶液。该区域相对于准备间为正压，空气可循环再利用。